Gén rezistencie na karbapenémy (KPC/NDM/OXA 48/OXA 23/VIM/IMP)
Názov produktu
Detekčná súprava HWTS-OT045 na gén rezistencie na karbapenémy (KPC/NDM/OXA 48/OXA 23/VIM/IMP) (fluorescenčná PCR)
Epidemiológia
Karbapenémové antibiotiká sú atypické β-laktámové antibiotiká s najširším antibakteriálnym spektrom a najsilnejšou antibakteriálnou aktivitou. Vďaka svojej stabilite voči β-laktamáze a nízkej toxicite sa stali jedným z najdôležitejších antibakteriálnych liekov na liečbu závažných bakteriálnych infekcií. Karbapenémy sú vysoko stabilné voči plazmidmi sprostredkovaným β-laktamázam s rozšíreným spektrom (ESBL), chromozómom a plazmidmi sprostredkovaným cefalosporinázam (enzýmy AmpC).
Kanál
PCR-zmes 1 | PCR-Mix 2 | |
FAM | Dlhodobo zodpovedný liek (IMP) | VIM |
VIC/HEX | Vnútorná kontrola | Vnútorná kontrola |
CY5 | NDM | KPC |
ROX | OXA48
| OXA23 |
Technické parametre
Skladovanie | ≤-18 ℃ |
Trvanlivosť | 12 mesiacov |
Typ vzorky | Spútum, čisté kolónie, rektálny výter |
Ct | ≤36 |
CV | ≤5,0 % |
Úroveň hádky | 103CFU/ml |
Špecifickosť | a) Súprava detekuje štandardizované negatívne referencie spoločnosti a výsledky spĺňajú požiadavky zodpovedajúcich referencií. b) Výsledky testu skríženej reaktivity ukazujú, že táto súprava nevykazuje žiadnu skríženú reakciu s inými respiračnými patogénmi, ako sú Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, Staphylococcus aureus, Klebsiella oxytoca, Haemophilus influenzae, Acinetobacter junii, Acinetobacter haemolyticus, Legionella pneumophila, Escherichia coli, Pseudomonas fluorescens, Candida albicans, Chlamydia pneumoniae, respiračný adenovírus, Enterococcus alebo vzorky obsahujúce iné gény rezistencie na liečivá CTX, mecA, SME, SHV, TEM atď. c) Protiinterferencia: Na interferenčný test boli vybrané mucín, minocyklín, gentamicín, klindamycín, imipeném, cefoperazón, meropeném, ciprofloxacín hydrochlorid, levofloxacín, kyselina klavulánová, roxitromycín a výsledky ukazujú, že vyššie uvedené interferujúce látky nemajú žiadnu interferujúcu reakciu na detekciu génov rezistencie na karbapenémy KPC, NDM, OXA48, OXA23, VIM a IMP. |
Použiteľné nástroje | Systémy Applied Biosystems 7500 pre PCR v reálnom čase Systémy QuantStudio®5 pre PCR v reálnom čase Systémy SLAN-96P PCR v reálnom čase (Hongshi Medical Technology Co., Ltd.) Systém PCR v reálnom čase LightCycler®480 Systém detekcie PCR v reálnom čase LineGene 9600 Plus (FQD-96A,Chang-čouBioerova technológia) Kvantitatívny termálny cyklér MA-6000 v reálnom čase (Suzhou Molarray Co., Ltd.) Systém BioRad CFX96 pre PCR v reálnom čase Systém BioRad CFX Opus 96 pre PCR v reálnom čase |
Pracovný postup
Možnosť 1.
Odporúčané extrakčné činidlo: Súprava na všeobecnú DNA/RNA s makro a mikrotestom (HWTS-3019-50, HWTS-3019-32, HWTS-3019-48, HWTS-3019-96) (ktorý sa dá použiť s automatickým extraktorom nukleových kyselín Macro & Micro-Test (HWTS-3006C, HWTS-3006B)) od spoločnosti Jiangsu Macro & Micro-Test Med-Tech Co., Ltd.. Do zrazeniny tallusu pridajte 200 μl fyziologického roztoku. Ďalšie kroky by mali byť v súlade s pokynmi na extrakciu a odporúčaný elučný objem je100 μl.
Možnosť 2.
Odporúčané extrakčné činidlo: Extrakčné alebo čistiace činidlo nukleových kyselín (YDP302) od spoločnosti Tiangen Biotech (Beijing) Co., Ltd. Extrakcia by sa mala začať presne v súlade s krokom 2 návodu na použitie (pridajte 200 μl pufru GA k zrazenine tallusu a pretrepávajte, kým sa tallus úplne nesuspenduje). Na eluovanie použite vodu bez RNázy/DNázy a odporúčaný elučný objem je 100 μl.
Možnosť 3.
Odporúčané extrakčné činidlo: Macro & Micro-Test Sample Release Reagent. Vzorku spúta je potrebné premyť pridaním 1 ml normálneho fyziologického roztoku k vyššie uvedenej upravenej zrazenine tallusu, centrifugovať pri 13 000 ot./min. počas 5 minút a supernatant zlikvidovať (ponechať 10 – 20 µl supernatantu). V prípade čistej kolónie a rektálneho výteru pridajte 50 µl činidla na uvoľňovanie vzorky priamo k vyššie uvedenej upravenej zrazenine tallusu a následné kroky by sa mali extrahovať podľa návodu na použitie.