Reakcia viacerých krajín na klaster hantavírusov v Andách: NAAT a sekvenovanie celého genómu ako kľúčové nástroje

V apríli 2026 polárna expedičná výletná loď pod holandskou vlajkouMS Hondiusodletel z Ushuaia v Argentíne. 6. apríla mal jeden z pasažierov horúčku a bolesti hlavy, na ktoré o päť dní neskôr zomrel na palube. Jeho manželka tiež ochorela a zomrela po prevoze do Južnej Afriky. Následne mal 69-ročný britský pasažier pozitívny test na hantavírus a zostáva na jednotke intenzívnej starostlivosti. K 13. máju Svetová zdravotnícka organizácia informovala11 prípadov a 3 úmrtiasúvisiace s vypuknutím nákazy na lodi.

I. Prehľad vírusov a patogénne typy

Hantavírusy sú skupinou RNA vírusov prenášaných prevažne hlodavcami, patriacimi do rodu Orthohantavirus z čeľade Bunyaviridae. Ich genóm pozostáva ztri segmenty (L, M a S), kódujúce RNA-dependentnú RNA polymerázu, glykoproteíny a nukleokapsidový proteín. Na základe geografického rozšírenia a klinických prejavov sa hantavírusy delia nadve hlavné skupiny:

Hantavírusy Starého sveta(vyskytuje sa v Európe, Ázii a Afrike) spôsobujeHemoragická horúčka s renálnym syndrómom (HFRS)Medzi reprezentatívne vírusy patrí vírus Hantaan (HTNV), vírus Seoul (SEOV) a vírus Puumala (PUUV). Primárne napádajú obličky, čo vedie k ich poškodeniu, hemoragickým prejavom a v závažných prípadoch k šoku. Miera úmrtnosti sa líši podľa typu vírusu, ale vo všeobecnosti sa pohybuje od<1 % až 5 – 15 %.

Hantavírusy Nového sveta(cirkuluje v Severnej a Južnej Amerike) spôsobujeHantavírusový pľúcny syndróm (HPS)Medzi reprezentatívne vírusy patrí vírus Sin Nombre (SNV) a vírus Andes (ANDV). Primárne napádajú pľúca a spôsobujú rýchlo sa rozvíjajúci nekardiogénny pľúcny edém, závažné respiračné ťažkosti a kardiovaskulárne ohrozenie. Počiatočné príznaky sú podobné chrípke (horúčka, bolesti svalov, gastrointestinálne ťažkosti), ale ochorenie môže rýchlo viesť k respiračnému zlyhaniu s...úmrtnosť dosahuje 30 – 50 %.

Prepuknutie nákazy výletnými loďami bolo spôsobené najmäAndský vírus (ANDV), ktorý patrí kHantavírusový pľúcny syndróm (HPS)podtyp.

II. Tradičné hantavírusy spojené s HFRS vs. vírus Andes (HPS)

Tradičný vysokofrekvenčný spaľovač tepla (HFRS)

III. Spôsoby prenosu

Hantavírus sa prenáša hlavne prostredníctvompriamy kontakt s výkalmi, slinami alebo močom infikovaných hlodavcovalebo podľavdýchnutie aerosólových výkalovMedzi ďalšie možné trasy patria:

- Uhryznutie alebo poškriabanie infikovanými hlodavcami;

- Konzumácia potravín kontaminovaných močom, trusom alebo slinami infikovaných hlodavcov;

- Dotýkanie sa očí, nosa alebo úst po kontakte s kontaminovanými predmetmi.

Prenos z človeka na človeka je extrémne zriedkavý, ale bolo potvrdené preAndský vírus (ANDV).

IV. Globálne sledovanie kontaktov s hantavírusom – testovanie a sekvenovanie nukleových kyselín ako kľúčové technológie

Po vypuknutí ANDV zdravotnícke orgány vo viac ako desiatich krajinách – vrátane Španielska, Spojeného kráľovstva, Spojených štátov, Kanady a Švajčiarska – súčasne spustili sledovanie kontaktov a monitorovanie karantény. Francúzsko, Spojené štáty a ďalšie krajiny naďalej sledujú zdravotný stav svojich občanov, ktorí sa vrátili zo zasiahnutej lode.

V rámci tejto reakcie na núdzové situácie vo viacerých krajinách,testovanie nukleových kyselín a genomické sekvenovaniezohrali nenahraditeľnú kľúčovú úlohu:

-Testovanie nukleových kyselínposkytuje definitívny dôkaz pre rýchlu identifikáciu patogénov;

-Genomické sekvenovanieponúka nenahraditeľné molekulárne dôkazy na sledovanie zdroja infekcie, potvrdenie prenosových reťazcov a posúdenie vírusových zmien.

V. Detekčné roztoky pre hantavírus (najmä typu HPS)

1. Včasná identifikácia patogénu

1.1 Testovanie v mieste poskytovania starostlivosti (POCT)
Presný skríning a núdzové testovanie –od vzorky po výsledok do 1 hodiny.
Diagnostické výzvy a rýchle molekulárne riešenia Testovanie v mieste starostlivosti
1.2 Konvenčná PCR
Konvenčná PCR

2. Sekvenčné riešenia

Na identifikáciu patogénov a sledovanie ohnísk v prípadochhorúčka neznámeho pôvodu, respiračné ťažkosti alebo hemoragické prejavy.
hemoragické prejavy

Základné vlastnosti:

Základné funkcie

VI. Overené údaje o výkonnosti

Dosiahnuté sekvenovanie celého genómu založené na zachytávaní sondou u vzoriek pozitívnych na hantavírus>99 % pokrytie genómu pri hĺbke 30×.
Overené údaje o výkonnosti

Genotypizácia hantavírusu a analýza podielu podtypov na základe odpadových vôd je uskutočniteľná.
podiel podtypov

VII. Súvisiace súpravy

Súvisiace súpravy


Čas uverejnenia: 14. mája 2026